مرکز مطالعات قرآن دانشگاه مفید در سال ۱۳۸۵ تأسیس شد. اهداف بزرگ این مركز عبارت‌اند از: تدوین و تبیین معارف قرآنی با توجه به علوم انسانی و پژوهش‌های میان‌رشته‌ای؛ گسترش فرهنگ و معارف قرآنی با تأكید بر مكتب اهل‌بیت(ع)؛ حمایت و پرورش پژوهشگران توانمند در گستره مطالعات قرآنی؛ مطالعه و بررسی مسائل نوین فكری جهان معاصر از منظر قرآن کریم و کوشش برای تبیین اصول مشترک در روابط انسانی در درون جوامع اسلامی و در سطح بین‌الملل.
این مركز در بیش از یك دهه فعالیت و در راستای تحقق اهداف خود، برنامه‌های مختلفی را در چهارچوب پروژه‌های تحقیقاتی همچون: برگزاری همایش‌ها، سخنرانی‌ها، کارگاه‌های دوره‌ای با همكاری استادان داخلی و خارجی و انتشار كتب و نشریه تخصصی مرتبط با مطالعات قرآنی و ... به انجام رسانده است. همچنین این مركز از سال ۱۳۹۳ به‌منظور نشر معارف قرآنی و ارائه دیدگاه‌ صاحب‌نظران در حوزۀ شناخت دینی، نشریه‌ای تخصصی با عنوان «دوفصلنامه پرتو وحی» را منتشر می‌کند.